呼和浩特博物馆现有两处馆址，分别为内蒙古博物馆旧馆和清•和硕恪靖公主府。内蒙古博物馆旧馆于2010年由自治区文化厅移交呼和浩特市人民政府，市政府决定划归呼和浩特市博物馆作为馆址；公主府是1989年由呼和浩特市博物馆接管呼和浩特市师范学校移交而成为现今呼和浩特市博物馆馆址的。

　　原内蒙古博物馆，现更名为呼和浩特博物馆。它不仅是我市地标性建筑，也是见证我市历史发展的重要单位。市委、市政府于2010年12月决定对呼和浩特博物馆进行改扩建工程，总改扩建面积为6950平方米，其中抗震加固工程4950平方米，新建文物修复中心和办公楼1200平方米，新建地下文物库房800平方米，项目总投资4510万元，建设期限为3年。

　　目前，呼和浩特博物馆的主体改造建设已经完工。2013年12月22日对外开放，举办了“走进呼和浩特——全国书法名家暨内蒙古名家作品观摩展”，并且接连承办了8个重要的临时展览。2014年12月31日，“呼和浩特精品文物展暨第二届皮雕皮画艺术品展”隆重开幕，呼和浩特博物馆正式启用后，将长期对外开放，充分展示我市各朝代历史文化和文明史发展过程。

　　呼和浩特博物馆清•和硕恪靖公主府位于呼和浩特市通道北路62号，是康熙皇帝六女儿和硕恪靖公主下嫁漠北喀尔喀蒙古土谢图汗部扎萨克多罗郡王敦多布多尔济所建府邸。始建于清康熙四十二年（1703），是全国唯一一座保存完好的公主府邸，总占地原六百余亩，府苑结合，现存主体建筑接近二十亩，其风格与明末清初京津地区王府相似，等级为“和硕”（郡王）。采用中国古代建筑体系中传统的中轴对称格局，大面积夯筑地基，主要为硬山式建筑。公主府分四进五重院落，前有影壁御道，后有花园马场，府门、仪门、静宜堂、寝殿、配房、厢房、后罩房依例分布。因其建筑精美，用料考究，工艺精湛，《绥远城通志稿》称“后枕青山，前临碧水，建筑与风景之佳为一方冠”。2001年获批全国重点文物保护单位，2009年4月30日正式对外开放。和硕恪靖公主府通过完整的公主府邸原貌展示，真实地反映了清代早期建筑工程技术、生活水平、民族习俗、文化艺术等方面的情况，是研究清代北部边疆地区历史不可多得的实物依据,也是边疆各族人民友好团结、共同开发边疆、建设边疆的历史见证。